В феврале 1905 был создан краеведческий музей. Инициатором создания музея являлся ревнитель старины, общественный деятель, присяжный поверенный Г.Н. Прозрителев. Долгое время музей находился в здании губернского правления. Структура данного культурного учреждения:
- -естественноисторический отдел с разделами по ботанике, зоологии, палеонтологии, минералогии, геологии; исторический отдел с разделами нумизматики и археологии;
- -этнографический отдел с разделами этнографии и антропологии;
- -сельскохозяйственный отдел с разделами шелководства, пчеловодства, виноделия, виноградарства, огородничества, садоводства, лесоразведения, лесоводства, животноводства, полеводства, земледелия;
- -отдел народного образования;
- -санитарно-гигиенический отдел;
- -отдел заводской и кустарной промышленности.
На первоначальном этапе в музее хранилось 10000 экземпляров. При краеведческом музее располагалась библиотека, фонд которой исчислялся 1710 книгами по истории и краеведению. Экспозиция состояла из природоведческого и исторического разделов. Во втором были представлены материалы по освоению Северного Кавказа и Кавказской войны, средневековой и древней истории региона. Очень познавательными и интересными были этнографические выставки, реконструирующие быт народов, которые когда-то населяли северокавказский регион. Главную ценность представляла экспозиция кавказского оружия, подаренного музею Прозрителевым.
В естественноисторическом отделе демонстрировались образцы растительного мира и минералов, чучела животных, палеонтологические находки. На базе музея проводили активную научно- просветительскую и научную деятельность. Большой урон учреждению был нанесён фашистскими оккупантами: изъяты экспонаты религиозного культа, полотна Верещагина и Айвазовского, этнографическая коллекция.
После окончания войны деятельность музея развернулась гораздо шире. В девяностые годы прошлого века создаются экспозиции по этнографии и истории Ставрополья с XVIII века, вводится экспозиция по палеонтологии и геологии. В этот период развивается выставочная деятельность, где используются привозные и собственные коллекции. В последние десятилетия краеведческий музей активизирует природоведческие, историко-этнографические, археологические экспедиции.
На 2005 год коллекция музея составила 1999615 единиц.